近来一些小伙伴留言要singleR中小鼠的小心数据集【IPTD-455】Real Race Queen AYA，呐，这不就来了嘛！
黄药师图片
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前边在单细胞器具箱|singleR-单细胞类型自动小心（含数据版）中先容了singleR进行自动化小心的要害以及2个东谈主的内置数据集，此次补充另外的5个小心数据集。
singleR自带的7个参考数据集，其中5个是东谈主类数据，2个是小鼠的数据：BlueprintEncodeData Blueprint (Martens and Stunnenberg 2013) and Encode (The ENCODE Project Consortium 2012) （东谈主）DatabaseImmuneCellExpressionData The Database for Immune Cell Expression(/eQTLs/Epigenomics)(Schmiedel et al. 2018)（东谈主）HumanPrimaryCellAtlasData the Human Primary Cell Atlas (Mabbott et al. 2013)（东谈主）MonacoImmuneData, Monaco Immune Cell Data - GSE107011 (Monaco et al. 2019)（东谈主）NovershternHematopoieticData Novershtern Hematopoietic Cell Data - GSE24759（东谈主）ImmGenData the murine ImmGen (Heng et al. 2008) （鼠）MouseRNAseqData a collection of mouse data sets downloaded from GEO (Benayoun et al. 2019).鼠）
以下两种得回姿色，按需自取
一 ，代码得回姿色
和网速和走访姿色琢磨【IPTD-455】Real Race Queen AYA
remotes::install_github("LTLA/celldex")library(celldex)ref <- HumanPrimaryCellAtlasData() save(ref,file = 'HumanPrimaryCellAtlasData.Rdata')ref <- BlueprintEncodeData() save(ref,file = 'BlueprintEncodeData.Rdata')ref <- MouseRNAseqData() save(ref,file = 'MouseRNAseqData.Rdata')ref <- ImmGenData() save(ref,file = 'ImmGenData.Rdata')ref <- DatabaseImmuneCellExpressionData() save(ref,file = 'DatabaseImmuneCellExpressionData.Rdata')ref <- NovershternHematopoieticData() save(ref,file = 'NovershternHematopoieticData.Rdata')ref <- MonacoImmuneData()save(ref,file = 'MonacoImmuneData.Rdata')
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